Mahri Nui dawniej była jedną z wiosek Matoran na Voya Nui. Około 300 lat przed przybyciem Inika (a 700 lat po Wielkim Kataklizmie) wioska zapadła się do oceanu i zniknęła w otchłani morza (niszcząc bazę Ehleka umieszczoną ponad Dołem). Matoranie tam żyjący (przez fanów zwani Aquatoranie lub Mahritoranie) ulegli przemianom spowodowanym mutagennym czynnikiem w wodach Dołu, ale nie spędzili tam dosyć czasu, aby zacząć oddychać pod wodą. Dlatego zaczęli hodować Hydruka, Rahi morskie, które zbierają dla nich powietrze znad lustra wody i znoszą je pod kopuły wioski. Jednak wioska zatonęła niebezpiecznie blisko więzienia Dół - żyjący tam Barraki terroryzują mieszkańców i zagrażają przyszłości wioski.

Matoranie zaczęli się mutować ze względu na wodę z Dołu poniżej, lecz mutację zatrzymało zamknięcie wioski w wielkich bańkach powietrza, znoszonych przez Hydruka - Rahi morskie podobne do skorpionów. Dlatego Matoranie wciąż oddychają powietrzem, inaczej niż nieszczęśliwe ofiary Dołu.

Matoranie bardzo rzadko opuszczają bańki wokół miasta. Aby wypasać Hydruka i zbierać powietrze, ustalili tzw. "bezpieczną godzinę". Trwa ona bardzo wcześnie rano, gdy Rahi polujące w nocy zasypiają, a te aktywne w dzień - dopiero się budzą. Bezpieczna godzina jest ściśle ograniczona - Reysa przekroczył ją o kilka minut i został pożarty przez Wielką Kałamarnicę.
Mahri Nui
Mahri Nui

Toa Mahri musieli zniszczyć podwodny korytarz, aby Voya Nui mogła wrócić do Wielkiego Kontynentu. Ponieważ oznaczało to zagładę Matoran z miasta, przenieśli ich w bezpieczne miejsce i dopiero wówczas Cordakami zniszczyli korytarz. Voya Nui zatonęła, niszcząc Mahri Nui.